Durante 19 años ha ejercido la profesión en las áreas de Derecho público, empresarial, tributario y derechos humanos.
Durante los años 2007 hasta el 2009, dictó la cátedra de Derecho Administrativo en la UEES.
En el 2012 fue asesora de la Subsecretaría Jurídica de la Presidencia de la República del Ecuador.
Cuenta con la certificación del Programa de Entorno Económico y Político Global, Gestión de Riesgos, Manejo de Crisis Institucionales y Prácticas Antisoborno de la Facultad de Justicia de la Universidad de Cambridge. Además cuenta con un Máster en prevención de violencia e inclusión
Desde septiembre del 2018 hasta la actualidad desempeña el cargo de Directora General del Servicio de Aduanas del Ecuador, institución en la cual implementó por primera vez una Oficina de Fortalecimiento Ético y Lucha contra la Corrupción.
Hoy la UEES reconoce los logros profesionales de la abogada Maria Alejandra Muñoz con la distinción “Huella UEES 2019”.
Nustro campus ubicado en Guayaquil – Ecuador cuenta con espacios propicios para la formación integral de los alumnos emprendedores, que fomentan la investigación en un ambiente sincero y cercano.